In einer diesen Monat veröffentlichten Studie sagen Schweizer Forscher, dass sie Dutzende bisher unbekannte Bakterienarten, die in Patientenproben gefunden wurden, genetisch sequenziert haben. Während viele dieser neuartigen Bakterien dem Menschen möglicherweise keinen Schaden zufügen, identifizierte das Team mehrere, die wahrscheinlich Krankheiten verursachen können.
Die Forschung wurde von Wissenschaftlern der Universität Basel und des Universitätsspitals Basel in der Schweiz durchgeführt. Seit 2014 sammelt das Team für ein besonderes Projekt Blut- oder Gewebeproben von bestimmten Patienten. Ärzte testen routinemäßig Patientenproben, um Bakterien zu finden, die eine plausible Ursache für die Krankheit einer Person sein könnten. Die Autoren der Studie entwickelten einen Algorithmus zur Identifizierung von Proben, bei denen mit herkömmlichen Testmethoden keine bekannten Bakterien nachgewiesen werden konnten. Anschließend sequenzierten sie das gesamte in diesen Proben gefundene genetische Material in der Hoffnung, bisher unentdeckte Bakterienarten zu finden.
Insgesamt fanden sie 61 Bakterienarten, die in diesen mysteriösen Proben lauerten. Davon scheinen 35 bisher nie dokumentiert worden zu sein. Einige der anderen „schwer zu identifizierenden“ Bakterien wurden erst kürzlich von anderen Forschern entdeckt und benannt. Die Ergebnisse des Teams sind veröffentlicht diesen Monat in der Zeitschrift BMC Microbiology.
„Unser neuer Algorithmus hat sich als leistungsstarkes Werkzeug zur Erkennung und Identifizierung neuartiger Bakterienorganismen erwiesen“, schreiben die Autoren in ihrer Arbeit.
Die meisten Bakterien und anderen Mikroorganismen, die in oder auf unserem Körper leben, sind entweder harmlos oder gesundheitsfördernd. Die Forscher identifizierten jedoch sieben Arten dieser neuen Bakterien, die als „klinisch relevant“ gelten, was bedeutet, dass sie wahrscheinlich Krankheiten verursachen können. Und selbst normalerweise harmlose Bakterien können je nach den Umständen manchmal gefährlich sein, etwa Hautbakterien, die in eine frisch geöffnete Wunde eindringen, oder opportunistische Infektionen bei Menschen mit geschwächtem Immunsystem.
Heutzutage ist es für klinische Labore schwierig, ratlos zu bleiben und eine mögliche Ursache für die Infektion einer Person nicht zu identifizieren. Aber wir sind es immer noch regelmäßig finden neuartige Keime da draußen. Um diese unbekannten Mikroben aufzuspüren, kann die Sequenzierung des gesamten Genoms eingesetzt werden, allerdings kann dies ein kostspieliger und relativ langwieriger Prozess sein. Daher hoffen die Forscher, dass ihr Algorithmus – NOVA genannt, kurz für Novel Organism Verification and Analysis – anderen Wissenschaftlern helfen kann, diese wichtige Arbeit zu beschleunigen.
Das Team arbeitet derzeit an der Benennung seiner neuen Entdeckungen und schlägt zwei Namen vor bereits eingereicht zur Prüfung durch die wissenschaftliche Gemeinschaft. Außerdem sammeln sie immer noch Proben und finden neue Bakterien. Zwischen Februar 2022 und Juli 2023 identifizierten sie ihrer Studie zufolge weitere 21 potenziell neuartige Bakterienarten.
„Wir stellen hier eine große Dynamik fest: Dank technologischer Fortschritte in der Bakteriologie wird viel mehr über neu entdeckte Bakterienarten veröffentlicht“, sagte Studienautor und Mikrobiologe Daniel Goldenberger in einem Stellungnahme.