Bei „The Avengers“, das er sowohl geschrieben als auch inszeniert hat, hatte Whedon mit Iron Man, Captain America, The Hulk, Thor, Black Widow, Hawkeye, Loki, Nick Fury und mehr zu tun. Die Seite fragte Whedon, ob etwas bei ihm geklickt habe, als er den Job bekam, weil er es gewohnt ist, mit Ensemble-Besetzungen zu arbeiten, sogar in seinem Comic-Buch, wie seiner Serie von „Astonishing X-Men“.
Dies sind Charaktere, die nicht nur von den Comics, sondern auch von früheren MCU-Filmen definiert wurden und Pläne entwickeln, die bereits vorhanden waren. Whedon sagte, „Nun, der erste Teil davon ist einfach außerordentlich lustig, nämlich ‚Was würden diese Charaktere zueinander sagen? Wie würden sie sich selbst definieren?’ Und ich musste ein paar Wochen damit verbringen, einfach in dieser Ozonzone zu schweben. ‘Was wäre, wenn wir das tun würden?’ und ‘Oh!'”
Er sagte jedoch, dass es ein Albtraum ist, wenn man „in die praktischen Dinge einsteigt, wie ‚Wie funktioniert dieser Typ …‘“. Er machte weiter:
„Und es ist wirklich ein wiederkehrender Albtraum, weil es in dieser Hinsicht so sehr wie ‚Serenity‘ war. Also dachte ich wirklich ‚Oh Gott, ich habe es schon wieder getan!‘ Weil „Serenity“ die Zähne zusammenzog, um die Struktur herauszufinden, und das gleiche galt für „The Avengers“. Und weil wir ein Veröffentlichungsdatum hatten, mussten wir mit der Produktion beginnen; es war zu diesem Zeitpunkt eine ziemlich beängstigende Erfahrung.
Eine Sache, die dazu führte, dass alles zusammenpasste, war die Tatsache, dass jeder dieser Charaktere der gleichen Bedrohung ausgesetzt ist, mit den gleichen Ereignissen zu tun hat und im Fall der meisten von ihnen auf das gleiche Ziel hinarbeitet.