Wolverine ist einer der härtesten und langlebigsten Helden im Marvel-Universum. Er hat einige der größten Bedrohungen auf der ganzen Welt angegriffen und wurde überhaupt nicht gebremst. Allerdings auf den Seiten von Wolverine: Das Ende, wurde eine Realität eingeführt, in der Logan sich mit seinem größten aller Feinde konfrontiert sah: seinem Bruder. Wolverines lang verschollener Bruder, John Howlett, Jr., besiegte Wolverine schließlich ein für alle Mal.
John Howlett Jr. war der erste Sohn von John und Elizabeth Howlett und wurde Ende des 19. Jahrhunderts geboren. Johns Kindheit war glücklich genug, als der Junge eine enge Beziehung zu seinem jüngeren Bruder James aufbaute. Die Dinge begannen sich zu entwirren, als er sah, wie seine Mutter den örtlichen Gärtner Tom Logan küsste. John konfrontierte seine Mutter und seine mutierten Kräfte manifestierten sich zum ersten Mal in seiner Wut – indem er ein Paar Knochenklauen aus seinen Händen streckte, mit denen er sie versehentlich aufschlitzte. John wurde von seinem Vater in eine Anstalt geschickt, um zu vermeiden, dass wegen dieser Enthüllung ein Skandal ausbricht, und seine Familie täuschte seinen Tod vor.
Er verbrachte Jahre in der Anstalt und wartete darauf, von seiner Familie befreit zu werden. Leider kamen sie nie – John war sich überhaupt nicht bewusst, dass seine Familie tatsächlich alle gestorben war, kurz nachdem er in das Chaos seines Bruders geschickt worden war, der auch seine eigenen Kräfte entwickelte. John wurde von einer Gruppe von Forschern aufgenommen – die Anfänge von Waffe X – die seine Kräfte und ihre Ursprünge erforschten. Schließlich entwickelte John eine sekundäre Mutation und die Fähigkeit, immateriell zu werden, befreite sich von seinen Entführern und entkam in die reale Welt, beobachtete seinen Bruder aus der Ferne und stellte seine Pläne für die Welt auf. Er war in der Lage, eine Reihe von Einrichtungen unter seinem Kommando einzurichten und sogar die verbleibende Technologie der inzwischen nicht mehr existierenden Waffe X zu übernehmen.
Als John seinen Bruder konfrontierte, war es über ein Jahrhundert her, seit sie sich das letzte Mal getroffen hatten. Als Logan alt wurde, verbrachte er Jahre isoliert in der kanadischen Wildnis und arrangierte einen Deal mit den Einheimischen, um Tierfelle im Austausch für Vorräte bereitzustellen. Je älter Wolverine wurde, desto mehr verlor er seinen Vorsprung. Logan kam aus seinem Versteck, um an der Beerdigung seines langjährigen Erzfeindes Sabertooth teilzunehmen. John folgte Wolverine und beobachtete ihn aus der Ferne und konnte Logan nach Japan locken. Dort konfrontierte er seinen Bruder. John bot ihm eine Position an seiner Seite an, aber Wolverine lehnte ab – stattdessen griff er ihn an und warf ihn von der Seite eines Berges.
Wolverine folgte ihm und kämpfte schließlich gegen John in Nevada. Wolverine war gezwungen zu versuchen, John daran zu hindern, ein Atombombenset zu aktivieren, um eine Kettenreaktion auszulösen, die die US-Wirtschaft zum Einsturz bringen und es John und seinen Verbündeten ermöglichen könnte, die Kontrolle über die Nation zu übernehmen. Wolverine verhinderte erfolgreich die Bombe und die beiden kämpften ein letztes Mal.
In der Rauferei konnte Logan John fangen, bevor er wieder unberührbar werden konnte, und stach ihm versehentlich durch die Brust. John starb in den Armen seines Bruders und deutete an, was er Wolverine erzählt hätte, wenn er nur die Chance gehabt hätte. Die Geschichte endet damit, dass Wolverine, der von seinem letzten Mord das Herz gebrochen hat, nichts tut, da er von bewaffneten Männern umgeben ist, die den Befehl haben, Wolverine sofort zu töten.
Diese Version von Wolverine verliert wirklich alles. Nachdem er den Kontakt zu seinen Verbündeten verloren hatte und fast vollständig isoliert war, war John der potenzielle Schlüssel zu einer Welt voller Informationen und Familie. Aber jetzt, nicht einmal durch Wolverines Absicht, werden seine Fragen zu seiner Vergangenheit für immer unenthüllt bleiben. Mehr als alles andere brach der Kampf gegen John Howlett Jr. Wolverines Geist und nahm dem Schläger das Feuer. Das ist das ultimative “Ende” für Wolverine: Wenn er sich einfach nicht mehr genug darum kümmert, um zu kämpfen.