Auch wenn Superfly der Hauptschurke in „Mutant Mayhem“ ist, gibt es einen Nebenschurken, der den ganzen Film über präsent ist. Ihr Name ist Cynthia Utrom. Gesprochen von Maya Rudolph mit einem unbestimmten europäischen Akzent, leitet die Figur das Techno Cosmic Research Institute (TCRI) und versucht, an den von Baxter Stockman (Giancarlo Esposito) geschaffenen Schlamm zu kommen, damit sie eine Mutantenarmee erschaffen kann ihr eigenes. Aber Baxter hat kein Interesse daran, Cynthia zu helfen, und er möchte einfach nur eine seltsame kleine eigene Familie haben, weil er Tiere liebt.
Nachdem es ihren Soldaten (oben zu sehen, wobei Utrom grün auf dem Bildschirm leuchtet) nicht gelingt, den von Baxter Stockman geschaffenen Schleim oder die Mutanten zu erreichen – aus denen sich schließlich Superfly, Bebop, Rocksteady, Mondo Gecko und ein Ganzes entwickeln Schwarm von Mutanten, die unbedingt Millionen anderer Kreaturen in mutierte Wesen verwandeln und die Menschheit dominieren wollen – Cynthia fängt die Schildkröten ein, damit sie sie für ihr Blut melken kann. Natürlich rettet Splinter seine vier Söhne und Cynthia geht mit leeren Händen zurück.
Sobald die Schildkröten die riesige, Kaiju-artige Version von Superfly besiegt haben, wurde TCRI tatsächlich komplett geräumt und niemand weiß, wohin sie gegangen sind. Aber eine Abspannszene zeigt, dass sie immer noch aus der Ferne zuschaut und noch einmal versuchen wird, die Schildkröten einzufangen. Beim nächsten Mal wird sie jedoch die Hilfe des Shredder in Anspruch nehmen, der in der Mid-Credits-Szene des Films gehänselt wird.
Aber es gibt noch mehr über Cynthia zu beobachten, und Fans der Franchise haben wahrscheinlich ein paar interessante Details über diese Figur mitbekommen.