Super Mario Bros. Wonder verkaufte sich in den ersten Wochen 4,3 Millionen Mal und wurde damit zum meistverkauften Mario-Spiel der Neuzeit. Nintendo sagte, dies gelte nicht für Mario-Spiele, die vor der Wii und dem DS verkauft wurden, da zuvor keine Software-Verkaufsdaten erfasst wurden.
Nintendo sagte, es sei optimistisch, dass Wonder weiterhin ein Verkaufserfolg sein werde, da Mario-Spiele „dazu neigen, sich über einen langen Zeitraum konstant zu verkaufen“. Das Unternehmen fügte hinzu, dass Wonder während der Feiertage eine „attraktive Wahl“ sein dürfte und die Verkäufe im Jahr 2024 ebenfalls gut sein dürften, sagte Nintendo.