Es scheint, dass Lin ziemlich schnell in die Produktion von „Star Trek Beyond“ hineingezogen wurde. Der Film befand sich noch in der Entwicklung, als der Großteil der Verantwortung plötzlich auf die Schultern des Regisseurs fiel. Glücklicherweise war Lin seit seiner Kindheit ein Trekkie, sodass er zumindest mit den Grundsätzen der Franchise vertraut war. Dennoch musste viel sehr schnell erledigt werden, was nicht der ideale Weg ist, einen Spielfilm zu machen. Lin drehte bereits eine Folge einer erfolgreichen TV-Serie, als ihm „Star Trek“ praktisch in den Schoß fiel. Er erklärte:
“Ich drehe „True Detective“ in Ventura und es ist ein Donnerstag. Ich bekomme einen Anruf von JJ Abrams und er fragt: „Hey Mann, ich bin nur neugierig, magst du „Star Trek“?“ Ich frage mich: „Ich bin mit meinem Vater aufgewachsen und habe mir „Star Trek“ angeschaut, es hat so viel zu bieten Bedeutung.’ Er sagte: „Haben Sie zufällig eine Idee für einen „Star Trek“-Film?“ Und ich sagte: „Sind Sie nicht in der Vorproduktion?“ Und er sagte: „Nein, nein, wir sind geschlossen.“ Er sagte: „Wenn Sie eine Idee haben, würden Sie dann am Montag im Büro vorbeikommen wollen?“
Das war es? Einfach etwas einfallen lassen? Glücklicherweise konnte Lin ziemlich schnell eine Idee entwickeln und, sobald sie genehmigt war, mit der Produktion beginnen, ein Drehbuch zusammenstellen und mit dem Bau der Sets beginnen. Lin rannte los und hatte Mühe, mitzuhalten. Er erinnerte sich:
“[O]Am Montag setzte ich mich mit JJ zusammen und erzählte ihm von der Idee zu „Star Trek Beyond“. Er sagt: „Großartig!“ Und das ist Ende Januar. Er sagte: „Machen wir es, aber wir müssen im Juni mit der Produktion beginnen.“ Kein Drehbuch. Nichts […] Es war hart. Das Schwierigste, was ich je tun musste.