Wie bei seinen Vorgängern Shin Megami Tensei 5 zielt darauf ab, dem Spieler so viel Inhalt und einen Grund zu geben, nach Abschluss des Spiels darauf zurückzukommen. Es gibt mehrere Enden und Inhalte nach dem Spiel, bei denen der Spieler bestimmte Routen durch die Geschichte nehmen muss, was den Wiederspielwert erhöht.