Die Matrix: Auferstehung lieferte einen neuen Antagonisten in Form von The Analyst, der ein viel schlimmerer Bösewicht ist als The Architect, und eine von Smiths Zeilen gegen Ende des Films beweist es. Es kommt nicht oft vor, dass das Publikum sieht, wie Neil Patrick Harris in einer schurkischen Rolle sein enormes schauspielerisches Können unter Beweis stellt, aber sein Analyst spielt eine entscheidende Rolle. Nach dem Untergang des ursprünglichen Matrix-Systems in Die Matrix: Revolutionen, Das gesamte System wurde von The Analyst neu aufgebaut. Auf den ersten Blick scheint die neue Matrix in Form und Funktion der ersten ziemlich ähnlich zu sein. Im Laufe der Zeit wird das Publikum jedoch darüber informiert, wie sehr sich die Dinge geändert haben, seit The Analyst die Kontrolle übernommen hat. Außerdem wird deutlich, dass The Analyst finsterere Methoden hat als sein Vorgänger The Architect (Helmut Bakaitis).
Während einige Theorien vermuten lassen, dass Neil Patrick Harris’ Charakter der verkleidete Architekt ist, sind die beiden unterschiedliche Charaktere mit unterschiedlichen Kontrollmethoden. Der Architekt wurde von anderen Maschinen hergestellt und erhielt ein menschliches Aussehen, um zu versuchen, die menschliche Natur zu verstehen. Seine kalte Art passt gut zum Original Die Matrix Raten als Titelschurke. Der Hass des Architekten auf menschliches Chaos ist greifbar; er liebt Präzision und die binäre Welt aus Einsen und Nullen, die er als „Utopie“ geschaffen hat. Während The Analyst zunächst nicht wie ein schlimmerer Bösewicht erscheint, ist er tatsächlich viel kalkulierter und grausamer als The Architect. Letztendlich beweist eine Zeile des aufgewerteten Agenten Smith (Jonathan Groff) dies gegen Ende des Films.
Als Agent Smith Neo und Trinity rettet Auferstehungen“ Analytiker, bemerkt er trocken, “Was ist aus der Welt geworden? Du kannst nicht einmal einem Programm vertrauen.” Es ist als trockener Witz gemeint, aber es unterstreicht, wie sehr The Analyst die Matrix verändert. Smith spürte die wahre Macht der Freiheit, nachdem er aus der falschen, geordneten Realität des Architekten erwacht war und schließlich lernte, den freien Willen und die Emotionen der Menschheit zu schätzen. Während der Architekt menschliche Emotionen als trivial abtat, verwendet der Analyst sie, um die Matrix zu manipulieren und zu kontrollieren. Das macht The Analyst nicht nur vorteilhafter, sondern auch grausamer als seinen Vorgänger. Als Agent Smith erkennt, was ihm und den Bürgern der Matrix geraubt wurde, wirft er dem Analysten diese Zeile ins Gesicht. Er spricht jedoch nicht nur über sich selbst, sondern über The Analyst. Während die Methode des Architekten, die Menschheit zu kontrollieren, vollständig auf Logik aufgebaut und daher nie persönlich war, kontrolliert der Analyst jetzt die Menschheit, indem er sie sehr persönlich macht.
Während The Architect wenig Interesse an den unordentlichen Teilen der Menschheit sah, in Die Matrix: Auferstehungen, Der Plan des Analytikers profitiert davon, menschliche Fehler und Emotionen gegen sie einzusetzen. Agent Smiths Leitung rein Auferstehungen knüpft auch an das Gespräch zwischen The Oracle und The Architect am Ende von an Die Matrix: Revolutionen. Der Architekt schlägt vor, dass Programme nicht lügen, wenn sie über den Waffenstillstand sprechen, indem er sagt: „Was glaubst du, was ich bin? Der Analyst lügt tatsächlich oft und es sind seine Lügen, die seine Version der Matrix über Wasser halten. Allerdings ist sein eigenes beabsichtigtes Utopia so voller obszöner Manipulationen, dass selbst Schurkenprogramme wie Agent Smith nicht mehr Teil davon sein wollen.
Während nichts über ein Fünftel berichtet wurde Die Matrix Folge, The Analyst ist immer noch da, was das Franchise für zukünftige Filme öffnet. Da Agent Smith anderen Programmen nicht einmal mehr vertrauen kann, gibt es Möglichkeiten, seinen Charakter zu erforschen. Obwohl, basierend auf Die Matrix: Auferstehung‘ Kassenausfall, ein Fünftel Matrix Film wird wahrscheinlich nicht passieren. Hoffentlich wird für Neo und Trinity keine neue Matrix entstehen und The Analyst wurde endgültig gestoppt.