Ein offensichtlicher Coronavirus-Stamm, der Mutationen sowohl der Omicron- als auch der Delta-Variante kombiniert, ist wahrscheinlich das Ergebnis einer Laborkontamination, sagten Wissenschaftler.
Am Wochenende kamen Befürchtungen auf, dass ein neuer Stamm von Covid mit dem Namen „Deltacron“ aus einem sogenannten Rekombinationsereignis hervorgegangen sei – bei dem zwei Varianten einen Patienten koinfizieren und Mutationen austauschen, um einen neuen viralen Nachwuchs zu produzieren.
Bisher wurden 25 Sequenzen von Deltacron gemeldet, aber Experten bestanden darauf, dass es keine Beweise dafür gibt, dass Omicron und Delta sich zusammengeschlossen haben, um eine neue Variante zu generieren.
„Dies ist mit ziemlicher Sicherheit keine biologische Rekombinante der Delta- und Omicron-Linien“, sagte Dr. Jeffrey Barrett, Direktor der Covid-19 Genomics Initiative am Wellcome Sanger Institute.
Stattdessen wurde vermutet, dass während des Sequenzierungsprozesses, der bei dem Versuch, eine Covid-Varianteninfektion zu identifizieren, stattfindet, versehentlich Fragmente von Omicron in das genetische Make-up von Delta eingefügt wurden.
Dies ist ein häufiger Fehler, der in jedem Labor auftreten kann, sagte Aris Katzourakis, Professor für Evolution und Genomik an der Universität Oxford.
Er erklärte, dass bei der Sequenzierung eines Virus sein Genom in genetische Fragmente zerlegt und dann analysiert wird, bevor es in einem Computer wieder zusammengesetzt wird.
Ein bestimmtes Fragment von Delta neigt jedoch dazu, während des Sequenzierungsprozesses „auszufallen“ und ist „anfällig gegen Kontamination“. Im Fall der 25 ‘Deltacon’-Proben scheint diese spezielle Lücke durch ein Omicron-Fragment gefüllt worden zu sein, sagte Prof. Katzourakis.
„Dies ist ein verräterisches Zeichen für eine laborinduzierte Rekombination“, sagte er.
Dr. Barrett sagte, dass die Mutationen von Deltacron, die anscheinend von Omicron abstammen, „genau und ausschließlich“ im Delta-Genomfragment lokalisiert seien, das „durch ein technologisches Artefakt bei bestimmten Sequenzierungsverfahren beeinflusst wird“.
Die 25 Proben, die Gisaid, einer globalen Datenbank für Varianten, gemeldet wurden, wurden in mehr als einem Land in mehreren Sequenzierungsverfahren verarbeitet, so Leondios Kostrikis, Professor für Biowissenschaften an der Universität von Zypern, der Deltacron erstmals identifizierte.
„Diese Ergebnisse widerlegen die undokumentierten Aussagen, dass Deltacron das Ergebnis eines technischen Fehlers ist“, sagte Prof. Kostrikis.
Prof. Katzourakis sagte jedoch, dass der Prozess des versehentlichen Kombinierens von Fragmenten von Varianten bei der Sequenzierung vieler Covid-Proben in einem Labor „ein häufiger Fehler“ sei. Es „passiert die ganze Zeit“, fügte er hinzu.
„Es ist nicht so, dass eine Rekombination zwischen Varianten unmöglich wäre. Das ist nur kein Beweis dafür.
„Wenn es ein echtes Rekombinationsereignis war, sollten die Deltacon-Sequenzen, wenn Sie einen Baum aus Delta- und Deltracron-Sequenzen erstellen, einen eigenen Zweig in diesem Baum bilden, der auf ihre gemeinsame Abstammung hinweist.
„Was Sie stattdessen sehen, ist eine Mischung aus den Deltacron-Sequenzen innerhalb des Deltabaums. Das bedeutet, dass sie keine eindeutige Abstammungslinie bilden.“
Unabhängig davon, wie es dazu kam, sind Experten und Beamte von Deltacron nicht betroffen.
“Es ist kein Grund zur Sorge”, sagte Professor David Matthews, ein Virologe an der University of Bristol.
Der zypriotische Gesundheitsminister Michael Hadjipantela sagte am Sonntag, dass Deltacron nicht besorgniserregend sei und dass weitere Details auf einer Pressekonferenz später in der Woche bekannt gegeben werden.
Professor Lawrence Young, Virologe an der Warwick University, sagte, der Fokus der breiteren wissenschaftlichen Gemeinschaft müsse darauf gerichtet sein, wie wir „das unvermeidliche Auftauchen neuer Varianten managen und wie diese validiert und berichtet werden.
„Solange sich das Virus in untergeimpften Regionen weiter ausbreitet, werden weiterhin Varianten auftauchen. Deshalb ist eine weltweite Impfung so wichtig.“