Wie die anderen Folk-Horrorfilme der Unheiligen Dreifaltigkeit setzt „Witchfinder General“ Szenen entsetzlicher Gewalt vor einem pastoralen Hintergrund. In der Eröffnungsszene baut ein Mann auf freiem Feld einen Galgen, bereit für eine verurteilte Hexe, während Matthew Hopkins von Vincent Price und sein sadistischer Assistent John Steame (Robert Russell) zusehen. Wir schreiben das Jahr 1645, und die Gesetzlosigkeit des Bürgerkriegs in England bietet Männern wie ihnen reichlich Gelegenheit, mit der Hexenjagd gutes Geld zu verdienen. Während die arme Frau hängt, machen sie sich auf den Weg zu ihrem nächsten Zahltag in das kleine Dorf Brandeston in Suffolk.
Der junge Roundhead-Soldat Richard Marshall (Ian Ogilvy) kehrt auf Urlaub nach Hause ins Dorf zurück, um den Priester John Lowes (Rupert Davies) um Erlaubnis zu bitten, seine Nichte Sara (Hilary Dwyer) zu heiraten. Der alte Mann gibt sein Einverständnis und lässt Marshall versprechen, dass er sie an einen sicheren Ort bringen wird, da sie zu Ausgestoßenen in der Gemeinde geworden sind. Marshall stimmt glücklich zu und schließt sich wieder seinem Regiment an.
In der Zwischenzeit treffen Hopkins und Steame im Dorf ein, um gegen Lowes zu ermitteln, der des Götzendienstes und der Hexerei beschuldigt wird. Sie versuchen, durch Folter ein Geständnis von ihm zu erzwingen, und Sara versucht, ihn zu retten, indem sie sich Hopkins anbietet. Sie schafft es jedoch nur, ihrem Onkel eine kurze Gnadenfrist im Gefängnis zu erkaufen, als Hopkins seine Meinung ändert, nachdem Steame sie sexuell angegriffen hat. Lowes wird zusammen mit zwei Frauen gehängt.
Marshall kehrt nach Brandeston zurück und schwört Rache, was ihn auf einen höllischen Weg bringt, der den aufrechten jungen Soldaten in einen rachsüchtigen Mann verwandelt, der genauso gewalttätig ist wie seine Feinde. „Witchfinder General“ ist eine krasse und beunruhigende Geschichte über Korruption, Gier und Machtmissbrauch; Im Gegensatz zu seinen fiktiven Gegenstücken in der Unheiligen Dreifaltigkeit bezieht es seine verstörende Kraft daraus, dass es auf realen Ereignissen basiert.